服務(wù)介紹

RNA pull-down是檢測(cè)RNA結(jié)合蛋白與其靶RNA之間相互作用的主要實(shí)驗(yàn)手段之一。RNA pull-down探針法原理：利用生物素標(biāo)記的RNA探針與目標(biāo)蛋白進(jìn)行體外結(jié)合，然后通過pulldown試劑盒將結(jié)合的復(fù)合物分離出來，最后對(duì)分離出來的復(fù)合物進(jìn)行檢測(cè)和分析。

RNA pull-down探針法技術(shù)原理

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

 

1. 體外轉(zhuǎn)錄線性RNA，特異性捕獲結(jié)合蛋白，效率高，實(shí)驗(yàn)風(fēng)險(xiǎn)低；

2. 線性circRNA可特殊設(shè)計(jì)（可接環(huán)化位點(diǎn)片段）。

客戶提供

 

1. 基因詳細(xì)信息：物種、基因名稱、長度和序列等；

2. 確定探針合成方式，進(jìn)行RNA pulldown探針設(shè)計(jì)評(píng)估，如有預(yù)測(cè)的蛋白結(jié)合區(qū)域需提前說明；

3. 新鮮細(xì)胞/組織樣本（組織≥100mg，細(xì)胞不少于1E+7個(gè)）；

4. 目標(biāo)蛋白抗體和抗體信息。

我們提供

 

1. 探針法RNA pulldown實(shí)驗(yàn)報(bào)告（方法、流程、實(shí)驗(yàn)結(jié)果） ；

2. 贈(zèng)送質(zhì)譜檢測(cè)；

3. 剩余探針。

案例1

參考文獻(xiàn)：

Wang S, Liu Y, Xiao H, Chen Z, Yang X, Yin J, Li Y, Yuan C, Yan S, Chen G, Gao Q, Kong B, Sun C, Song K. Inhibition of SF3B1 improves the immune microenvironment through pyroptosis and synergizes with αPDL1 in ovarian cancer. Cell Death Dis. 2023 Nov 27;14(11):775. doi: 10.1038/s41419-023-06301-1. PMID: 38012150; PMCID: PMC10682409.

案例2

參考文獻(xiàn)：

Fang L, Huang H, Lv J, Chen Z, Lu C, Jiang T, Xu P, Li Y, Wang S, Li B, Li Z, Wang W, Xu Z. m5C-methylated lncRNA NR_033928 promotes gastric cancer proliferation by stabilizing GLS mRNA to promote glutamine metabolism reprogramming. Cell Death Dis. 2023 Aug 15;14(8):520. doi: 10.1038/s41419-023-06049-8. PMID: 37582794; PMCID: PMC10427642.