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人工設計circRNA以解鎖新技能:基因沉默

發布時間:2025-02-07        瀏覽量:[ 453 ]

最近,環狀RNA(circRNA)在臨床前和臨床研究成果斐然。circRNA作為新型核酸藥物,在核酸適配體、基因編輯、預防或治療疫苗、細胞療法、蛋白替代療法等多個方向展現出顯著的應用優勢。


circRNA是否有更大的發揮空間,滿足更廣泛的臨床需求?

circRNA可以競爭性結合miRNA,間接調控mRNA的表達。那么circRNA是否也可以直接與mRNA相互作用?

RNA-RNA相互作用會影響mRNA的穩定性,circRNA是否可以直接參與mRNA的降解,從而實現沉默基因?


最新研究


近日,韓國科學技術院Yoon Ki Kim研究團隊Molecular Cell期刊上發表研究論文:Circular RNAs trigger nonsense-mediated mRNA decay[1]。研究揭示了circRNA靶向調控無義介導的mRNA降解(NMD)機制,為circRNA在基因沉默和疾病治療中的潛在應用開辟了廣闊前景。






無義介導的mRNA降解(NMD)機制可以識別和下調含有過早終止密碼子(PTC)的錯誤mRNA,通過防止產生截斷和潛在有害的蛋白質,維持基因表達的保真度。NMD的執行依賴外顯子連接復合體(EJC)的正確定位。


circRNA可通過與mRNA的3’UTR的相互作用,促進mRNA的快速降解,而且結合位點越多,效果越強。這種相互作用將通過circRNA上的EJC定位在mRNA的3’ UTR附近,從而導致NMD,被稱為circNMD。circNMD依賴于mRNA翻譯。人工設計兩種circRNA變體,以靶向ATG5 mRNA 3’UTR相互作用,顯著下調了ATG5 mRNA水平,并且聯用效果更好。(圖1)


圖1 人工設計的circRNA引發靶向性circNMD。


思路打開


相比同樣可以進行基因沉默的miRNA,circRNA具有更高的穩定性,因而半衰期會更長,作用效果會更顯著。circRNA可以通過circNMD靶向mRNA并介導其降解的發現,彰顯了其在介導沉默基因表達方面的巨大潛力。


然而,要想達到有效的circNMD,仍需解決諸多問題:circRNA和mRNA的3’UTR序列堿基配對的最優規則是什么?最佳位置在哪里?在掌握了最佳靶向mRNA的規則之后,是否可以通過人工設計并體外制備circRNA來招募EJC,同時靶向mRNA,以實現circNMD?此外,如何實現circRNA的大規模制備,延長體外合成的circRNA的半衰期以及有效控制其對體內免疫的影響效果?這些問題的解決將為新型circRNA作為基因沉默治療藥物的研發提供有力的支持。


療法開發


綜上,基于circNMD原理,開發基因沉默療法,序列設計是關鍵。吉賽生物可提供個性化的circRNA序列設計服務。此外,吉賽生物擁有先進的RNA環化專利技術,包括基于I型內含子自剪接法circPrecise?和T4連接酶法的circPure?,可實現精準、高效、高質量的circRNA體外環化。吉賽生物提供circRNA藥物開發一站式CRO服務,為circRNA新型藥物的研發提速。



參考資料


[1]https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(24)00947-X?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS109727652400947X%3Fshowall%3Dtrue