服務(wù)介紹

蛋白質(zhì)是生命功能的執(zhí)行者，直接體現(xiàn)生命活動(dòng)的多樣性和復(fù)雜性。蛋白質(zhì)組學(xué)研究是指在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征，蛋白組研究可以反映、注釋和表征特定表征或疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)，為預(yù)測(cè)、診斷、治療和預(yù)防醫(yī)學(xué)應(yīng)用發(fā)展奠定基礎(chǔ)。

蛋白組研究主要內(nèi)容

蛋白質(zhì)定性與定量分析；蛋白質(zhì)功能研究；翻譯后修飾；亞細(xì)胞定位；參與的代謝途徑；蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)或其它分子間的相互作用。

蛋白組研究應(yīng)用領(lǐng)域

（1）基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)/生物醫(yī)藥領(lǐng)域

① 診斷標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)：篩選和鑒定疾病特異的生物標(biāo)記分子，作為疾病診斷、預(yù)后效果等的重要證據(jù)。

② 治療靶點(diǎn)挖掘：識(shí)別與健康或疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)作為潛在治療或預(yù)防靶點(diǎn)，分析蛋白質(zhì)靶點(diǎn)的可藥性，針對(duì)靶點(diǎn)設(shè)計(jì)和開發(fā)新藥。

③ 新藥研發(fā)：一方面可以研究候選藥物成分，另一方面可以聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組信息分析藥物作用機(jī)理和毒理，篩選有效藥物，改進(jìn)藥效和藥物安全性。

④ 調(diào)控機(jī)制研究：研究蛋白質(zhì)之間、DNA/RNA與蛋白質(zhì)之間的相互作用，分析基因之間的協(xié)同和拮抗作用，理解生物網(wǎng)絡(luò)和系統(tǒng)生物學(xué)。

⑤ 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)研究：針對(duì)未知蛋白質(zhì)或多肽，分析其氨基酸序列并預(yù)測(cè)空間結(jié)構(gòu)，以及研究其功能作用，改進(jìn)基因注釋，發(fā)現(xiàn)新基因功能等。

⑥ 發(fā)病機(jī)制與病理進(jìn)程研究：研究疾病發(fā)生時(shí)的蛋白質(zhì)分子變化，以及不同病理階段分子水平的差異，揭露疾病發(fā)生的分子機(jī)制，促進(jìn)后續(xù)藥物篩選以及患者的病程管理等。

（2）其他領(lǐng)域

①農(nóng)林：抗逆脅迫機(jī)制，生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制，育種保護(hù)研究等。

②畜牧業(yè)：肉類及乳制品等品質(zhì)研究，致病機(jī)理研究等。

③微生物：致病機(jī)理，耐藥機(jī)制，病原體-宿主相互作用研究等。

蛋白組研究策略

（1）非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)

又稱發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要事先了解目標(biāo)蛋白的信息，能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)樣本進(jìn)行全面高通量的定量和鑒定，可以同時(shí)檢測(cè)和分析樣本中的多個(gè)蛋白質(zhì)，更關(guān)注蛋白質(zhì)篩選和動(dòng)力學(xué)。數(shù)據(jù)依賴性采集模式（Data dependent acquisition，DDA）和數(shù)據(jù)非依賴性采集模式（Data independent acquisition，DIA）是質(zhì)譜分析中常用的兩種數(shù)據(jù)采集模式。

DDA：在一級(jí)質(zhì)譜的每個(gè)時(shí)間窗口進(jìn)行檢測(cè)循環(huán)時(shí)，選擇性采集信號(hào)相對(duì)較強(qiáng)的肽段離子進(jìn)入二級(jí)質(zhì)譜碎裂。因此，DDA無(wú)法有效的采集到信號(hào)強(qiáng)度較弱的信號(hào)離子，限制了檢測(cè)靈敏度，采集結(jié)果具有一定隨機(jī)性，無(wú)法對(duì)大量樣品完成可重復(fù)性的位點(diǎn)分析。

代表性技術(shù)：

① 4D-Label-free：無(wú)需化學(xué)標(biāo)簽（如同位素）標(biāo)記肽段；DDA采集模式；利用四維（保留時(shí)間、質(zhì)何比、離子強(qiáng)度、淌度）分離離子，可鑒定蛋白的有無(wú)情況。

② TMT：通過同位素標(biāo)簽標(biāo)記肽段；DDA采集模式；混樣上機(jī)，可消除批次效應(yīng)。

DIA：采集所設(shè)置的最低強(qiáng)度值以上的所有肽段離子進(jìn)行二級(jí)質(zhì)譜分析，遺漏的數(shù)據(jù)少，準(zhǔn)確定更高。

代表性技術(shù)：

① 4D-DIA：4D和label free蛋白組技術(shù)基礎(chǔ)上，采用DIA采集模式，覆蓋度、穩(wěn)定性好。

② Astral DIA：基于新一代Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀，結(jié)合了四極桿質(zhì)量分析器（Quadrupole）、軌道阱質(zhì)量分析器（Orbitrap）以及全新非對(duì)稱軌道無(wú)損質(zhì)量分析器（Astral），分辨率、靈敏度、覆蓋度、穩(wěn)定性全方面提升。

Astral DIA蛋白組學(xué)優(yōu)勢(shì)

l 高覆蓋率：2ug Hela細(xì)胞裂解液60min掃描梯度，能測(cè)定12000多個(gè)蛋白；

l 高靈敏度：250pg Hela細(xì)胞裂解液18min掃描梯度，能測(cè)定5335多個(gè)蛋白；

l 高穩(wěn)定性：針對(duì)真菌和E.coli多樣本分析，88%鑒定蛋白CV<20%，75% CV<10%；

l 檢測(cè)速度快，周期短：1天可測(cè)定180個(gè)樣本，共獲得147萬(wàn)多個(gè)蛋白。

（Source：https://www.thermofisher.com/）

（2）靶向蛋白組學(xué)

通過預(yù)先選擇目標(biāo)蛋白針對(duì)性的分析復(fù)雜混合物，進(jìn)行定量和分析，類似ELISA或Western blot等技術(shù)，更側(cè)重于檢測(cè)目標(biāo)蛋白質(zhì)/多肽的絕對(duì)定量。

代表性技術(shù)：

① P7k/11k：化學(xué)合成并修飾得到DNA適配體（Aptamer），篩選出針對(duì)目標(biāo)蛋白特異性識(shí)別的適配體。能達(dá)到與單克隆抗體相當(dāng)?shù)挠H和力，進(jìn)而對(duì)目標(biāo)蛋白進(jìn)行廣泛、特異、準(zhǔn)確地定量分析。

② Olink：基于PEA技術(shù)（Proximity Extension Assay，PEA）的靶向高敏微量體液蛋白質(zhì)組學(xué)，通過抗體對(duì)目標(biāo)蛋白特異性識(shí)別、結(jié)合抗體末端寡核苷酸序列的擴(kuò)增，實(shí)現(xiàn)對(duì)疾病與生理過程中血清、血漿等各類體液樣本中目標(biāo)蛋白的定量分析。

③ PRM：基于LC-MS/MS的靶向蛋白質(zhì)分析技術(shù)，能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白、目標(biāo)肽段(包括發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進(jìn)行高選擇性、高特異性、高重復(fù)性和高準(zhǔn)確性檢測(cè)，實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白/肽段的相對(duì)或絕對(duì)定量分析。

動(dòng)物組織類：常規(guī)動(dòng)物組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等)、軟體動(dòng)物(血吸蟲、旋毛蟲等)、脂肪組織(白色)、動(dòng)物堅(jiān)韌組織-軟骨、動(dòng)物堅(jiān)韌組織-硬骨、動(dòng)物堅(jiān)韌組織-毛發(fā)、FFPE (石蠟切片)、活檢穿刺組織；

植物組織類：軟組織(木本植物的葉、花等，草本科植物，藻類，蕨類植物，大型真菌等)、木本科植物的樹根、樹皮、樹枝等、果實(shí)、種子、花粉；

微生物類：菌類；

細(xì)胞類樣品：懸浮培養(yǎng)細(xì)胞、貼壁培養(yǎng)細(xì)胞、亞細(xì)胞器樣本(如線粒體等)；

體液類：血清、血漿、動(dòng)物乳汁或人乳汁、乳脂肪球膜蛋白(MFGM)（即脂質(zhì)層）、腦脊液、關(guān)節(jié)液、淋巴液、附睪腔液、唾液、淚液、尿液、房水、玻璃體液、肺泡灌洗液；

其他類：分泌蛋白、細(xì)胞上清；

注：以上僅為參考樣品類型，具體送樣建議請(qǐng)聯(lián)系公司專業(yè)人員。