代謝組學是研究生物體內代謝產(chǎn)物(即代謝組)的科學。代謝產(chǎn)物包括了所有小分子物質,如氨基酸、脂質、糖類、核苷酸等,這些小分子在細胞和生物體內的生物化學過程中扮演著重要角色。這些代謝產(chǎn)物的變化可以反映出生物體的生理狀態(tài)、疾病狀態(tài)以及環(huán)境因素對生物體的影響等。代謝組學致力于全面而系統(tǒng)地分析一個生物體內的所有代謝物,從而獲得整體的代謝圖譜。
代謝組研究主要內容
代謝物的鑒定和定量;代謝途徑的解析;多組學聯(lián)合分析等。
代謝組學研究應用領域
(一)醫(yī)學領域
①疾病研究和診斷:代謝組學在疾病研究中尤為重要。通過分析患者的代謝組,可以識別與疾病相關的代謝物和代謝途徑,為疾病的早期診斷和個性化治療提供依據(jù)。例如,代謝組學在癌癥、糖尿病、心血管疾病等領域的應用已經(jīng)取得了一些突破性成果。
②藥物開發(fā):代謝組學可以幫助藥物研發(fā)人員了解藥物在體內的代謝過程,評估藥物的安全性和有效性。通過對藥物代謝物的研究,可以優(yōu)化藥物結構,提高藥物的治療效果,并減少副作用。
③代謝機制調控研究:研究不同外界刺激或者生理、病理狀態(tài)下機體代謝途徑的變化,揭示機體面對不同暴露環(huán)境下的響應機制,以及不同病理階段機體內的代謝變化機制。
(二)其他領域
① 環(huán)境與營養(yǎng)研究:代謝組學能夠揭示環(huán)境因素(如污染物)和飲食對生物體代謝的影響。通過對環(huán)境暴露和營養(yǎng)攝入的代謝組學分析,研究人員可以制定更有效的公共健康政策和營養(yǎng)干預策略。
② 植物科學與農(nóng)業(yè):代謝組學在植物科學和農(nóng)業(yè)中也具有重要應用。例如,通過分析植物的代謝組,可以了解植物對不同環(huán)境條件的響應,進而改良作物品種,提高作物的產(chǎn)量和質量。
③ 微生物組學:代謝組學也被廣泛應用于微生物組的研究。通過分析微生物的代謝產(chǎn)物,研究人員可以了解微生物與宿主的相互作用以及微生物群落的功能,從而推動微生物組在健康和疾病中的應用研究。
代謝組學通過分析生物體內所有代謝產(chǎn)物來揭示其生理狀態(tài)和生物學機制。根據(jù)研究策略的不同,代謝組學主要分為非靶向代謝組學、靶向代謝組學和脂質組學三大類別。每種研究策略都有其特定的技術特點和應用領域。
(1)非靶向代謝組學(Untargeted Metabolomics)
非靶向代謝組學旨在全面、無偏向性檢測和分析生物樣本中的所有代謝物,以生成整體的代謝特征圖譜。由于其全面的特性,非靶向代謝組學廣泛應用于發(fā)現(xiàn)新的生物標志物、研究代謝途徑的變化和探索疾病的潛在機制。
① 植物代謝組學
植物代謝組學能夠盡可能多、無偏向性的檢測植物樣本內的小分子代謝物,研究不同種類或不同處理條件下的植物代謝物(主要包括初級代謝物如糖類、氨基酸、核苷酸等,次級代謝物如生物堿、黃酮類、酚類等)的變化情況。
② 土壤代謝組學
對土壤中的小分子代謝物進行無偏向性的檢測。多應用于不同處理下根系分泌物的變化,以及植物-微生物互作機制的研究中。
脂質組學
③ 脂質組學(Lipidomics)
代謝組學的一個重要分支,專注于研究脂質類代謝物的組成和功能。脂質組學在研究脂質代謝異常、疾病機制和藥物作用機制中具有重要應用。例如,它在心血管疾病、糖尿病、神經(jīng)退行性疾病等領域的研究中提供了寶貴的數(shù)據(jù)。此外,脂質組學還在食品科學、環(huán)境研究中展現(xiàn)了其潛力。
④ 全譜代謝組學
全譜代謝組學是通過優(yōu)化提取方法,同時提取、分析生物樣本中親水代謝物和脂質的非靶向代謝組學,從而實現(xiàn)對研究體系內全面代謝網(wǎng)絡進行分析。
(2)靶向代謝組學(Targeted Metabolome)
靶向代謝組學專注于對特定代謝物(目標代謝物)或代謝物類別進行精確的定量分析。在藥物開發(fā)、臨床診斷和生物標志物驗證等方面有著重要應用。
靶向kits
產(chǎn)品名稱 | 檢測內容 | 代表性物質 |
能量代謝kit | 高度覆蓋中樞碳代謝、TCA循環(huán)、糖酵解、磷酸戊糖途徑中的物質 | 乙酰輔酶A、果糖-6-磷酸、三磷酸腺苷、延胡索酸等 |
氨基酸及其衍生物kit | 常見氨基酸及其衍生物 | 谷氨酸、賴氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸等 |
膽汁酸kit | 游離膽汁酸、結合型膽汁酸 | 牛磺膽酸、石膽酸、鵝脫氧膽酸、原膽酸等 |
中長鏈脂肪酸kit | C6-C20等多種中長鏈脂肪酸 | 肉豆蔻酸、棕櫚酸、油酸、亞麻酸等 |
短鏈脂肪酸kit | C2-C6等多種短鏈脂肪酸 | 乙酸、丙酸、丁酸、戊酸等 |
神經(jīng)遞質kit | 常見神經(jīng)遞質 | 腎上腺素、多巴胺、血清素、GABA等 |
花生四烯酸kit | COX、LOX等經(jīng)典代謝途徑中的代謝物 | 花生四烯酸、前列腺素、白細胞三烯、12S-HETE等 |
色氨酸代謝通路kit | 色氨酸3條代謝通路中的代謝物 | 色氨酸、犬尿氨酸、吲哚、血清素、褪黑激素等 |
水溶/脂溶性維生素kit | 覆蓋常見水溶和脂溶性維生素 | 維生素B1、B2、B3、B6、B9;維生素A、D、E、K等 |
TMAO及其相關代謝物kit | 覆蓋TMAO及前體物質 | 膽堿、甜菜堿、TMA、TMAO等 |
植物激素kit | 常見八大類植物激素 | 水楊酸、茉莉酸、脫落酸、赤霉素、玉米素等 |
類黃酮kit | 覆蓋黃酮、黃酮苷、異黃酮等種類 | 槲皮素、山奈酚、沒食子兒茶素、木樨草素等 |
高通量靶向代謝組學H650 |
對近650種代謝物進行絕對定量分析
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高通量靶向脂質組HL2400 | 對生物樣本的中的2400+種脂質物質進行分析 | |
高通量靶向代謝組學HA3000 | H650+HL2400組合產(chǎn)品 |