Polysome profiling 實(shí)驗(yàn),是利用核糖體沉降系數(shù)較大的特性,用蔗糖密度梯度離心的方法分離多聚核糖體。由于核糖體是細(xì)胞里密度最高的生物大分子,一條 mRNA 上結(jié)合的核糖體越多,在蔗糖密度梯度離心時(shí)的沉降速率越快,因此結(jié)合不同數(shù)量核糖體的mRNA 通過離心在溶液中會(huì)被分開。離心結(jié)束后將蔗糖溶液由底部緩慢抽出,即可對(duì)結(jié)合有不同數(shù)量核糖體的組分進(jìn)行分離,可以直觀地反映細(xì)胞內(nèi)翻譯的狀態(tài)。
Polysome profiling 是一種翻譯組學(xué)的研究方法,其操作流程為先用放線菌酮或氯霉素處理樣本,然后裂解細(xì)胞,離心并取上清液,之后將上清液轉(zhuǎn)移至蔗糖梯度上進(jìn)行超離。最后,進(jìn)行核糖體檢測(cè)及分離。研究人員可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要,繼續(xù)做 PCR 定量分析、蛋白質(zhì)提取等實(shí)驗(yàn)。
Polysome profiling實(shí)驗(yàn)流程概要(source:Su D, et al., 2024)