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  • 宏基因組測序(Metagenomics)

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  • 服務介紹


    對微生物群體進行高通量測序,通過數據分析特定環境中微生物群體基因組成及功能,研究微生物多樣性、種群結構、生物進化與環境之間的關系,解讀微生物群體多樣性與豐度,微生物與宿主之間的關系,發掘和研究新的、具有特定功能的基因,挖掘具有應用價值的基因資源,應用于開發新的微生物活性物質。

    60 宏基因組.png

    微生物宏基因組測序技術路線



    測序方案


    測序平臺:Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

    測序模式:PE150

    測序數據量:5-10 Gb raw data





  • 生物信息分析

    基礎分析

    物種組成和豐度統計

    樣品復雜度分析

    樣品間物種豐度差異分析

    基因組組裝

    基因組組分分析

    基因功能GO-COG注釋

    基因功能KOG、KEGG注釋

     

    自定義分析

    多樣品顯著相關因子分析

    與疾病相關的基因的深度分析

    菌群共生關系網絡構建

    系統進化樹構建




  • Table1.宏基因組測序原始樣本送樣建議

    送樣類型

    送樣量

    備注

    糞便、土壤等環境樣本

    ≥2g


    Table2.宏基因組測序DNA樣本送樣建議

    送樣類型

    送樣量

    濃度

    純度

    DNA

    ≥4μg

    ≥30ng/μl

    無蛋白/鹽離子等污染


    *更具體的送樣方法請詳詢銷售或技術支持


    物種范圍:常見有參微生物,詳詢銷售或技術支持



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