T7高產量RNA合成試劑盒使用T7 RNA聚合酶(T7 RNA Polymerase)進行體外轉錄,以含有T7啟動子序列的線性雙鏈DNA為模板、NTPs為底物對啟動子下游DNA序列進行轉錄,使客戶能夠簡單快速地獲得大量RNA產物。本試劑盒也能以修飾核苷為底物獲得生物素、染料或放射性標記的RNA,以帽子結構或帽子類似結構為底物獲得加帽的RNA。本試劑盒內含常用的修飾核苷供轉錄需求選擇使用。
轉錄合成的RNA可用于RNA結構和功能研究、RNase保護、探針雜交、anti-sense RNA和 RNAi等應用,也可通過加帽加尾產生mRNA,用于體外翻譯、轉染等下游應用。
運輸與保存方法
≤0℃運輸;-25℃~-15℃保存。
1、轉錄產物產量低或轉錄失敗
模板的質量與產量密切相關,實驗組產量明顯低于對照組可能原因有:①可能是模板自身原因;②實驗模板中有抑制反應的成分。
建議:①重新純化模板;②確定模板定量以及其完整性;③延長反應時間;④加大模板投入量;⑤嘗試其它的啟動子和RNA聚合酶。
2、產物電泳拖尾現象
可能原因有:①實驗操作過程被RNase污染;②DNA模板被RNase污染。
建議:①實驗過程中使用RNase-free的槍頭和EP管,佩戴一次性乳膠手套和口罩,所有試劑均用RNase free H2O 配制;②重新純化模板DNA。
3、RNA轉錄長度大于預期
如果電泳后的條帶大于目標條帶,可能原因有:①質粒模板沒有完全線性化;②RNA存在未完全變性的二級結構;③有義鏈3'端為突出結構。
建議:①確認模板結構,檢查模板是否完全線性化,如有必要,額外進行線性化;②將電泳方式由瓊脂糖膠換成變性膠來檢測RNA產物。
4、RNA轉錄長度小于預期
如果電泳后的條帶小于于目標條帶,可能原因有:①模板序列中包含類似于T7 RNA聚合酶的終止序列;②模板中GC含量高形成高級結構。
建議:①降低反應溫度(比如,30℃),有時降低溫度可以增加轉錄長度,但會降低產量;②不同的聚合酶識別不同的終止序列,若模板中含終止結構,建議嘗試不同的 RNA 聚合酶;③若模板GC含量高,采用42℃進行轉錄反應,或者添加SSB蛋白提高轉錄效率。